蒙城县疾病预防控制中心组建于2006年7月，是政府举办的疾病预防控制和公共卫生技术管理与服务的公益性副科级全额事业单位，其主要职责是在县卫健委领导下，在省、市疾病预防控制中心的指导下，承担辖区内疾病预防控制与公共卫生技术管理与服务工作。领导职数一正三副，中心主任丁浩，中心副主任李银梅、王天、孙凯。内设有综合办公室、免疫规划科、疫苗管理科、健康教育信息科、检验科、结核病防治科、艾滋病防治科、食品与环境卫生股、精神卫生科、公卫办、慢性非传染病防治科、地方病与寄生虫病防治科、学校卫生股、急性传染病防治科、职业病防治股等15个科（股）室共同组成。

中心实验室配备了美国PerkinElme ClarusGC680型气相色谱仪、珀金埃尔默PinAAcle990T原子吸收分光光度计、北京海光AFS-9530原子荧光分光光度计、山东海强WIN-8A四通道低本底αβ 测量仪、skalar san++ 连续流动分析仪、瑞士万通Eco IC离子色谱仪等一批先进仪器设备，保证测定数据的高灵敏度、高准确度、高精密度。开展了理化检验、微生物学检验、血清学检验、临床医学检验项目。具有对传染病病原学、水质、公共场所、职业危害因素、健康相关产品等检测能力。

我中心坚持贯彻预防为主的卫生方针，为全县疾病预防工作做出了做出了卓越的贡献。锐意进取努力争先，荣获国家省市多项荣誉。2020年6月，中共安徽省委授予县疾控中心“安徽省先进党组织”；安徽省总工会授予县疾控中心“工人先锋号”；12月安徽省委、安徽省人民政府授予县疾控“抗击新冠肺炎疫情先进集体”；连续多年参加万步有约大赛，2021年、2022年取得全省第一的好成绩。